Территория заказника находится в долине рек Малый Ессентучок и Подкумок, простирается вдоль северного подножья хребта Боргустан, сложенного обломочными и карбонатными породами мелового периода, и входит во вторую санитарную зону охраны минеральных источников Ессентукского месторождения.

В долине рек Малый Ессентучок и Подкумок произрастают пойменные, горно — лесные и горно — степные виды редких древесных пород колхидского типа.

Южная часть долины рек Малый Ессентучок и Подкумок покрыта степной и лугово — степной растительностью: ковылем красивейшим, ятрышником пурпурным, ятрышником трехзубчатым, асфоделиной крымской, асфоделиной тонкой, пионом узколистным, пыреем ковылелистным, рябчиком кавказским, которые включены в Красную книгу Российской Федерации, а также байрачными дубово — грабовыми лесами.

Всего в долине рек Малый Ессентучок и Подкумок произрастает до 1300 видов болотных, луговых и пойменных биологических типов растений.

Животный мир, типичный для лесостепной зоны, в том числе:

  • беспозвоночные: ручейник тонкоусый, ручейник большой;
  • насекомые: жужелица кавказская, включенная в Красную книгу Российской Федерации, дыбка степная;
  • рептилии: водяной уж, тритон кавказский, черепахи;
  • птицы: зимняк, черный коршун, копчик луни, жаворонки, совы, пустельга; воробьиные, врановые, а также включенные в Красную книгу Российской Федерации — черный гриф, белоголовый сип, стервятник;

млекопитающие: волк, косуля, кабан, лисы, зайцы, ежи, мышевидные грызуны